兩種電池的正極材料不同，成本也不同。磷酸鐵鋰電池正極采用磷酸鐵，三元鋰電池正極采用三元材料。三元鋰電池的能量密度高于磷酸鐵鋰電池，三元鋰電池的成本也高于磷酸鐵鋰電池。一些三元鋰電池的陽極由鎳、鈷和錳制成，一些三元鋰電池的陽極由鎳、鈷和鋁制成。

三元鋰電池將用于高端電動車或插電式混合動力汽車但是三元鋰電池的安全性不如磷酸鐵鋰電池，很多以安全為導向的電動車都會使用磷酸鐵鋰電池。比亞迪的許多電動汽車都使用磷酸鐵鋰電池。磷酸鐵鋰電池害怕低溫，因為磷酸鐵鋰電池中的化學反應沒有三元鋰電池那么活躍，很多磷酸鐵鋰電池在低溫環(huán)境下使用時容量會下降更多。

即使一些磷酸鐵鋰電池在低溫環(huán)境下使用也不能正常放電。許多電動汽車也在努力解決這個問題。很多高端電動車都會給電池組配備加熱系統(tǒng)和冷卻系統(tǒng)，這樣可以讓電池組一直保持在一個很好的工作溫度范圍內。